南沙三期始终秉持绿色发展理念，紧密围绕绿色智慧港口建设战略，以科技创新持续赋能新质生产力提升。截至目前，已申请国家专利56项，获得授权45项，其中实用新型专利33项、发明专利12项，并拥有计算机软件著作权14项。在科研荣誉方面，累计获得省部级以上科学技术奖10余项、市级质量管理小组奖20余项。共参与编制标准化文件5项，包括主持团体标准1项、参编企业标准4项。技术团队发表论文40余篇（来源中国知网、万方数据库）。公司荣获广州港集团2019-2023年度“科技创新标杆单位”称号。
在绿色技术应用方面，南沙三期大力推进自动化信息化技术引进改造和新能源生产设备的应用。155台大型作业设备已全部实现电力驱动，并陆续投用102台纯电动集装箱牵引车，港区内电动生产设备总数已达265台。实现船舶岸电供电全覆盖，岸基供电能力显著增强。
2020年，南沙三期成为广州港首个荣获“四星级（中国）绿色港口”称号的码头。2024年，“港口电动设备智能调度技术”入选交通运输行业低碳技术推广目录。2025年，公司成功取得环境管理体系（ISO 14001）与能源管理体系（ISO 50001）双项国际认证。
2018年至2024年期间，南沙三期按批次、分区域推进码头，前沿和堆场装卸作业、水平运输等自动化建设与改造，逐步构建起“前沿远控半自动 + 堆场全自动 + 水平运输无人驾驶”的自动化作业模式。
在前沿自动化方面，12台岸桥已全面实现全天候远程控制与半自动化运行，堆场区域形成50台自动化轨道吊集群，并成功接入自动化堆场智能调度系统，实现对设备集群作业的全流程智能化管理与调度。
自2024年起，南沙三期正全力推进广州港首个设备自动化改造示范区项目，该项目致力于打造“前沿远控半自动 + 堆场全自动 + 水平运输自动驾驶”为一体的智慧港口全流程混行作业示范区，进一步提升港口运营效率与智能化水平。
自动化堆场项目基于传统集装箱码头的作业流程，通过产、学、研、用相结合联合研发了自动化调度系统，与传统码头TOS生产资源进行协同，制定最佳生产策略并自动派发作业指令。这一系统实现了自动化堆场的智能调度管理、数据驱动生产和实时作业监控等功能。同时，通过自动化调度与传统调度模块独立运算作业数据，使传统作业任务与自动化作业能够兼容并行，适应了传统码头“边运营，边改造，边建设”的节奏。此外，该系统具备多种接口标准协议的适配能力，可以与不同自动化设备厂商的ECS系统相连接，分发自动化作业指令，实现不同主机厂商的自动化设备集群的全面智能调度，南沙三期自动化堆场已经实现了全天候作业，每个班次12人控制50轨道吊作业，经济效益非常明显。
南沙三期始终以集团和股份公司整体发展战略为指导，不断优化完善信息化基础设施，不断深化智慧港口建设，积极推进数字化转型，提升信息化、数字化、智能化、智慧化服务水平。同时，为了便捷可靠的客户体验、开放协同的港口生态、高效安全的智能码头和透明可视的智能管理，公司紧紧围绕作业效率、工艺流程、港机自动化技术、信息化与数字化水平提升、节能低碳、本质安全等六大重点领域的难题，攻克多道技术难关，开港迄今先后研发应用了79项科技项目。其中多项科研成果已落地应用，如智慧港机平台、自动化堆场智能调度系统、港口机械设备管理系统、纯电动牵引车充电智能调度管理系统以及港口作业策划智能仿真系统等，科技创新工作得到了有力推进，成效显著，为提升港口生产安全、质量与效率提供了强有力的保障。
南沙三期依托先进的码头操作系统（TOS），通过深度整合智能收箱、智能配载、智能调度等核心子系统，成功推动码头生产模式从 “经验驱动” 全面转向 “数据驱动”。在此基础上，借助各环节的智能协同，构建起从预约到提箱的全流程高效服务体系，为客户带来端到端的优质体验，成为夯实码头核心竞争力的关键支撑。
同时，南沙三期以新技术的规模化应用为抓手，全面升级业务管理水平：以车船、货物、人力等基础要素为依托，以生产作业为核心枢纽，将全码头生产流程纳入系统化管理框架，促成各生产部门的紧密联动与高效协同，最终实现向客户提供更高效、更便捷的服务体验，进一步强化了码头的综合运营效能。
